Secara default, jika kita install mysql server via port maka data-data dari database yang ada dalam mysql server akan tersimpan pada dir /var/db/mysql
Akan merepotkan kalau ternyata partisi /var kita terlalu kecil, sehingga data nambah sedikit aja partisi /var udah penuh.
Ada 2 cara untuk mensiasati hal tsb,
pertama ada merubah letak data directory pada file konfigurasi mysql kita my.cnf.
Hal ini memerlukan perubahan pada file konfigurasi my.cnf
# ee /var/db/mysql/my.cnf
[mysqld]
datadir=/data/mysqlbaru
Create directory tempat data baru disimpan
# mkdir /data/mysqlbaru
merubah owner directory tsb menjadi milik mysql
#chown -R mysql:mysql /data/mysqlbaru
kemudian start mysql
# /usr/local/etc/rc.d/mysql-server start

Cara kedua adalah dengan memindah dan melakukan linking directory mysql.
Detailnya sbb :

matikan server :
# /usr/local/etc/rc.d/mysql-server stop
# cd /var/db
pindahkan directory data mysql ke directory baru yang kapasitasnya lebih lega :
# mv mysql /data
lakukan linking directory
# ln -s /data/mysql /var/db/mysql
start server :
# /usr/local/etc/rc.d/mysql-server start